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ChEMBL 数据库中数据库中pChEMBL值的公式是什么?

发布时间:2023-10-13 22:16:44
发布人:xqq

一、ChEMBL 数据库中数据库中pChEMBL值的公式

在 ChEMBL 数据库中,pChEMBL 值是一种用于表示化合物活性的常用指标。它是将原始活性值转换为负对数(以10为底)的方式来表示化合物的活性。

pChEMBL 值的计算公式如下:

pChEMBL = -log10(activity)

其中,activity 是化合物的原始活性值。通常,活性值是以摩尔浓度、IC50、EC50、Ki 等形式表示的,具体取决于实验测定方法。在计算 pChEMBL 值之前,应根据实验结果中给出的活性单位进行适当的转换和标准化。

通过将活性值转换为 pChEMBL 值,可以更方便地比较和分析不同化合物的活性,并进行结构活性关系(Structure-Activity Relationship,SAR)的研究。pChEMBL 值的使用还有助于对活性值进行归一化,以便更好地进行跨实验和跨项目的比较和集成。

ChEMBL 数据库中的 pChEMBL 值是根据实验数据进行计算和提供的,并且可能涉及一些特定的数据处理和筛选方法。因此,在使用 pChEMBL 值时,应了解相关数据的来源和处理方法,并根据具体需求进行适当的解释和分析。

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