Linux中的环境变量是一种在操作系统中定义的全局变量，用于存储各种系统和用户配置信息。在Linux系统中，有两种类型的环境变量，一种是系统环境变量，另一种是用户环境变量。

系统环境变量是在操作系统启动时加载的，它们对所有用户都是可见的。这些变量通常包含一些重要的系统路径和配置信息，比如Java的安装路径、系统库路径等。系统环境变量的设置是通过修改系统的配置文件来实现的，一般位于/etc目录下的profile文件或者profile.d目录中的脚本文件中。

用户环境变量是每个用户独立设置的，只对该用户有效。用户环境变量通常包含一些个人化的配置信息，比如用户的家目录、个人脚本路径等。用户环境变量的设置是通过修改用户的配置文件来实现的，一般位于用户的家目录下的.bashrc或者.profile文件中。

当系统环境变量和用户环境变量出现冲突时，系统会按照一定的优先级规则进行处理。具体来说，系统环境变量的优先级高于用户环境变量，即如果系统环境变量和用户环境变量中存在同名的变量，系统会使用系统环境变量的值而不是用户环境变量的值。

如果你想要解决Linux中的Java环境变量和系统环境变量的冲突问题，可以采取以下几种方法：

1. 修改用户环境变量：你可以在用户的配置文件（如.bashrc或.profile）中设置Java环境变量，确保用户环境变量中的Java路径正确设置。这样，在用户登录时，系统会加载用户环境变量并覆盖系统环境变量中的同名变量。

2. 修改系统环境变量：如果你希望系统范围内都使用相同的Java环境变量，可以直接修改系统的配置文件（如/etc/profile或/etc/profile.d/java.sh）来设置Java环境变量。这样，所有用户登录时都会加载系统环境变量中的Java路径。

3. 使用软链接：如果你不想修改系统或用户的环境变量设置，还可以通过创建软链接来解决冲突。你可以将Java的可执行文件链接到一个自定义的路径中，并将该路径添加到系统或用户的环境变量中。这样，当你执行Java命令时，系统会自动使用软链接指向的Java路径。

总结一下，Linux中的环境变量分为系统环境变量和用户环境变量，当两者存在冲突时，系统环境变量的优先级更高。为了解决Java环境变量和系统环境变量的冲突，你可以修改用户环境变量、修改系统环境变量或者使用软链接来指定Java路径。选择适合你需求的方法，可以有效解决这个问题。